传说永清县北钊是燕王讨北招兵买马之地。清真寺始建于明朝,1819年永定河发大水被淹。
1909年重建新寺。本村回族田玉辛(人称田五巴巴)在京城开“三元店”和“宾乐店”,为建清真寺在民间和官方筹集了大量资金和原料。
该寺建造三年,占地三亩。建成后,田五巴巴在京城请来圣旨金匾一块,悬在殿内北墙正中,其两侧金匾均为知名人士所赠。